山西中医药大学学报

2013, v.14(04) 56-58

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人类PPARγ基因5′-非翻译区转录调控序列生物信息学分析
Bioinformatics Analysis on Sequences of Transcriptional Control of 5'-untranslated Region of Human PPARγ Gene

林绍鹏;魏伟民;

摘要(Abstract):

目的:对人类PPARγ基因5′-非翻译区进行生物信息学的分析。方法:通过搜索网络数据库,得到PPARγ基因翻译起始点上游约2 kb的序列。运用PROMOTER SCAN分析该序列可能的启动子区域,利用在线分析软件EMBOSS、MethPrimer和CpG Island Searcher分析该序列潜在的CpC岛,运用TFSEARCH软件分析该序列潜在的转录因子结合位点。结果:人类PPARγ基因5′-非翻译区转录起始位点上游反向链2 425到2 175区具有启动子活性,在启动子上具有TATA盒。PPARγ基因5′-非翻译区转录起始位点上游2 kb序列存在包括MyoD、HSF和Nkx-2等19个转录因子的潜在结合位点,不存在CpG岛。结论:该实验为后续的PPARγ基因的转录调控研究奠定基础。

关键词(KeyWords): 生物信息学;PPARγ;启动子;转录调控

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 广东省科技计划项目(2011B061300004)

作者(Author): 林绍鹏;魏伟民;

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